Hooibroei kan worden voorkomen door hooi droog op te slaan. Ook is het belangrijk om rekening te houden met het soort gras waarvan hooi wordt gemaakt. Nieuw ingezaaide graslanden met hoogwaardige grassoorten zijn ongeschikt om hooi van te maken en ook stevig bemest hooi gebruiken is riskant. Boeren doen er verstandig aan om grote balen in plastic te wikkelen, waardoor zuurstof (toevoer) wordt afgesloten en broei wordt voorkomen.
